Field Detail

• vwr

  private Viewer vwr

• eval

  private ScriptEval eval

• evalTemp

  private JmolScriptEvaluator evalTemp

• queueThreads

  private java.lang.Thread[] queueThreads

• scriptQueueRunning

  private boolean[] scriptQueueRunning

• commandWatcherThread

  private JmolThread commandWatcherThread

• scriptQueue

  public javajs.util.Lst<javajs.util.Lst<java.lang.Object>> scriptQueue

• useCommandWatcherThread

  private boolean useCommandWatcherThread

• scriptIndex

  private int scriptIndex

• isScriptQueued

  private boolean isScriptQueued

• prevCovalentVersion

  private static int prevCovalentVersion

Constructor Detail

• ScriptManager

  public ScriptManager()

Method Detail

• getScriptQueue

  public javajs.util.Lst<javajs.util.Lst<java.lang.Object>> getScriptQueue()

  Specified by:

  getScriptQueue in interface JmolScriptManager

• isScriptQueued

  public boolean isScriptQueued()

  Specified by:

  isScriptQueued in interface JmolScriptManager

• setViewer

  public JmolScriptEvaluator setViewer​(Viewer vwr)

  Specified by:

  setViewer in interface JmolScriptManager

• newScriptEvaluator

  private ScriptEval newScriptEvaluator()

• clear

  public void clear​(boolean isAll)

  Specified by:

  clear in interface JmolScriptManager

• addScript

  public java.lang.String addScript​(java.lang.String strScript,
                                    boolean isQuiet)

  Specified by:

  addScript in interface JmolScriptManager

• addScr

  private java.lang.Object addScr​(java.lang.String returnType,
                                  java.lang.String strScript,
                                  java.lang.String statusList,
                                  boolean isQuiet)

• clearQueue

  public void clearQueue()

  Specified by:

  clearQueue in interface JmolScriptManager

• waitForQueue

  public void waitForQueue()

  Specified by:

  waitForQueue in interface JmolScriptManager

• isQueueProcessing

  public boolean isQueueProcessing()

  Specified by:

  isQueueProcessing in interface JmolScriptManager

• flushQueue

  private void flushQueue​(java.lang.String command)

• startScriptQueue

  private void startScriptQueue​(boolean startedByCommandWatcher)

• getScriptItem

  public javajs.util.Lst<java.lang.Object> getScriptItem​(boolean watching,
                                                         boolean isByCommandWatcher)

  Specified by:

  getScriptItem in interface JmolScriptManager

• startCommandWatcher

  public void startCommandWatcher​(boolean isStart)

  Specified by:

  startCommandWatcher in interface JmolScriptManager

• interruptQueueThreads

  void interruptQueueThreads()

• clearCommandWatcherThread

  public void clearCommandWatcherThread()

• queueThreadFinished

  public void queueThreadFinished​(int pt)

  Specified by:

  queueThreadFinished in interface JmolScriptManager

• runScriptNow

  public void runScriptNow()

• evalFile

  public java.lang.String evalFile​(java.lang.String strFilename)

  Specified by:

  evalFile in interface JmolScriptManager

• evalStringWaitStatusQueued

  public java.lang.Object evalStringWaitStatusQueued​(java.lang.String returnType,
                                                     java.lang.String strScript,
                                                     java.lang.String statusList,
                                                     boolean isQuiet,
                                                     boolean isQueued)

  Specified by:

  evalStringWaitStatusQueued in interface JmolScriptManager

• checkScriptExecution

  private java.lang.String checkScriptExecution​(java.lang.String strScript,
                                                boolean isInsert)

• checkResume

  private boolean checkResume​(java.lang.String str)

• checkStepping

  private boolean checkStepping​(java.lang.String str)

• evalStringQuietSync

  public java.lang.String evalStringQuietSync​(java.lang.String strScript,
                                              boolean isQuiet,
                                              boolean allowSyncScript)

  Specified by:

  evalStringQuietSync in interface JmolScriptManager

• checkHalt

  public boolean checkHalt​(java.lang.String str,
                           boolean isInsert)

  Specified by:

  checkHalt in interface JmolScriptManager

• getAtomBitSetEval

  public BS getAtomBitSetEval​(JmolScriptEvaluator eval,
                              java.lang.Object atomExpression)

  Specified by:

  getAtomBitSetEval in interface JmolScriptManager

• scriptCheckRet

  public java.lang.Object scriptCheckRet​(java.lang.String strScript,
                                         boolean returnContext)

  Specified by:

  scriptCheckRet in interface JmolScriptManager

• openFileAsync

  public void openFileAsync​(java.lang.String fileName,
                            int flags)

  From file dropping.

  Specified by:

  openFileAsync in interface JmolScriptManager

  Parameters:

  fileName -

  flags - 1=pdbCartoons, 2=no scripting, 4=append

• getDragDropFileTypeName

  private java.lang.String getDragDropFileTypeName​(java.lang.String fileName)

• getZipDirectoryAsString

  private java.lang.String getZipDirectoryAsString​(java.lang.String fileName)

• setStateScriptVersion

  public static void setStateScriptVersion​(Viewer vwr,
                                           java.lang.String version)

• addHydrogensInline

  public BS addHydrogensInline​(BS bsAtoms,
                               javajs.util.Lst<Atom> vConnections,
                               javajs.util.P3[] pts)
                        throws java.lang.Exception

  Specified by:

  addHydrogensInline in interface JmolScriptManager

  Throws:

  java.lang.Exception